集装箱是烟台港发展的核心业务，共有包括中远海运、京汉、海丰等20余家船公司在烟台港开辟了日本、韩国、东南亚等航线，日韩集装箱航线达到19班/周。依托自营船舶，运营“锦州-烟台”“烟台-泉州”“烟台-广州”等南北自营干线，并凭借莱州、寿光、滨州及东营广利等自营支线，着力打造环渤海湾集装箱中转基地，构筑了以烟台港为中心，涵盖环渤海、东三省、长江沿线、珠三角和华东华南地区的内贸集装箱运输网络，成为环渤海湾集装箱运输业中的专业驿站。